超声波流量计的换能器的安装位置应尽量选择远离扰动区、流场平顺、施工难度小的位置，应避开管路的焊接位置和凹凸不平处，不宜选择在弯头、变径、阀门、节流装置等能产生压降的设备的下游，因为管道中的流体当压力降低时会不同程度释放出气体，这些气体会减弱超声波信号的强度，同时会产生噪声，影响到流量测量的准确度。由于气体会聚集在管道的最高处，为避免流量计由于夹杂有气体或空气或者空管而造成测量误差和功能异常，同时应避免将流量计安装在该位置。换能器可以选择安装在水平管段或者垂直管段，选择垂直管段的部位时，优先选择管中流体向上流动的位置，当现场条件不具备时，才考虑流体自上向下流动的管段，但此时需保证管道内的背压，确保流体满管平稳流动。
对于单声道超声波流量计，其精度要比多声道超声波流量计的精度差一些，为提高单声道超声波流量计的测量准确性，在实际工程设计时，还应尽量保证单声道超声波流量计安装位置的上游侧30倍管径长度的范围内没有影响流体扰动的阀门、水泵、节流孔等。
水电站中测量机组过机流量时，超声波流量计宜安装在蜗壳前压力钢管水平直管段上，超声波流量计换能器安装位置前后的直管段长度应满足前10D后3D(部分厂家要求前10D后5D)，在无法满足前10D后3D直管段长度要求的情况下，安装位置的上游直管段宜大于其下游直管段的长度。对于水泵水轮机，由于需要兼顾水轮机和水泵两种工作模式，需满足前10D后10D的直管段条件。对于无法满足直管段条件的水电站，可采用交叉声道面配置、采用更多的声道数以提高复杂流场条件下的流速代表性。
